三江源区生态补偿政策实施以来，取得了较好成效，针对当前三江源区生态补偿存在的问题和短板，本研究提出以青海与全国人均GDP差额人口总和为补偿标准，建立国家对青海的专项生态补偿转移支付制度，支持帮助青海尽快建立既利于生态保护又利于长远可持续发展的科学发展模式。
