上海合作组织军事合作稳步推进，许多机制性会议取得突破性进展，联合反恐演习进入机制化轨道。但随着上海合作组织进入关键发展时期，在军事合作领域，上海合作组织又面临着如何处理同集体安全条约组织的关系、如何提升军事合作的效率、如何应对美军撤出阿富汗后的中亚形势等一系列问题。对此，上海合作组织应继续坚持新型地区安全合作组织定位，确立合理的战略目标，妥善处理同其他组织的关系，不断完善军事合作机制，拓展军事合作的范围。
