《阿尔及尔协定》的签署最终结束了伊朗人质危机，美国通过解除制裁换取伊朗释放人质。但作为一个新生政权，伊朗政府所担心的问题仍然没有解决，《阿尔及尔协定》并不能阻止美国干涉其内政。虽然美国政府从来不承认其对伊朗政策目的是要更迭其现政权，但实际上美国历届政府都在支持伊朗反政府人士，希望通过所谓的民主计划来改变伊朗现政权，从而彻底消除它给美国带来的威胁。此外，制裁的贸易禁令虽然被取消了，财政部外资控制办公室也再次发放许可证，但前国王及其亲属的资产仍然被冻结，并没有归还给伊朗，财政部外资控制办公室制定的资产冻结的新法规一直延续到现在。而且里根政府很快在反恐问题上对伊朗发难，进行了新的制裁。与此同时，《阿尔及尔协定》的签署带来了不少争论，许多问题仍值得深思。第一，人质危机期间，美国国内法院收到很多对伊朗的诉讼，这些诉讼带来对一些理论问题的争论。如伊朗是否拥有主权豁免，这种豁免权是否有限，美国冻结或扣押伊朗资产是否具有合法性等。第二，由于部分伊朗资金存放在美国银行在欧洲国家的分行，美国国内的冻结令是否适用于域外也成为影响欧美关系的一个重要问题。对于美国冻结令的域外适用问题，欧洲国家明确表示反对，认为其侵犯了本国的主权。第三，美国国内对总统是否有权力取消本国国民索赔的权利，这种做法是否干预了司法权、是否违反美国宪法等存在争论。总统有权在外交事务上代表国家签订协议，但对于他是否有权签署人质不能索赔的协议仍然存在争论。这些问题并没有随着人质被释放、《阿尔及尔协定》的签署而解决，反而成为伴随美伊关系的重要问题。要求美国对干预摩萨台政府道歉、归还前国王巴列维的资产，仍是多年来伊朗对美国提出的和解条件。美国国内关于总统权力的范围及其与国会、司法机构的关系，仍是美国问题研究的重要内容。