封建、郡县论是近世日本儒者辨析幕藩体制优劣的重要依据。近世初期这一论争虽受中国影响，但山鹿素行、熊泽蕃山基于日本自古以来的历史根基与政治现实而得出的各类结论，反映出日本儒者力图超越中国自秦汉以来的郡县制的意图，体现了其封建、郡县论与幕藩体制相契合的“时处位”原则。徂徕学派的复古封建论以尊先王、复古制为名目，推崇“作为”、“道术”与“法度”，突出幕藩体制因时制宜、随时变法的优势。到近世后期，由于商品经济发展和内部阶层对幕藩体制的冲击，开始出现了反幕藩体制类型的封建、郡县论争。它既是推翻幕藩体制的重要依据，其衍生出的本国优位思想及“脱儒入法”倾向，也影响了近代日本政治思想和对外观。
