边疆安全理论除了价值基点是人的安全、理论范式是“和合主义”、主要问题域是边疆安全的治理外，其研究内容的外层是边疆安全在整个国家安全中的位置和重大意义。中间层次是边疆安全的内容，它包括以下三个层次的内容。第一个层次是实体边界安全，因为没有以边界线为基线的边界，就无法确定边疆。其内容突出陆、海、空等国家边界安全及相邻国家领土、领海、领空边界安全，从性质上来说实体边界安全属于传统安全，因为国家主权、领土不受侵犯是靠军事、政治、外交等传统安全策略维系的。第二个层次是边疆地区各族人民的安全，它又可以分为两个方面。第一个方面从国家角度来说，可分多民族国家、单民族国家及跨国民族国家边疆安全，其内容是以人的安全为基础的民族安全，其核心则是民族认同与国家边疆认同；第二个方面是以国家利益为中心而涉及影响边疆各个民族安全的地缘政治、局部国际关系及全球化因素等。第三个层次是边疆安全问题的本质——边疆各族人民国家认同问题。边疆安全是以以国家边疆为界的边疆地带各族人民的安全为核心内容，人是边疆安全中最能动、最积极的因素。如果没有人，地理上的边界就失去了意义，因为是建立自己国家的人划定的边疆。因此，边疆地区的各族人民是否认同所在国，即国家认同与民族认同是否重合和一致，就成为边疆安全的核心问题，因而构成边疆安全研究内容的核心。