郑洛新国家自主创新示范区的设立为推动河南省创新驱动发展带来了重大契机和挑战。为更好地推进示范区自主创新能力建设，本文通过访谈、问卷调查等方式对示范区自主创新能力建设进行了深入研究，全面地剖析了示范区自主创新能力建设进程中存在的问题和障碍，分析了自主创新能力形成机制的激励效果，以期为郑洛新示范区自主创新能力建设提供有益参考。研究发现，自示范区成立以来，示范区自主创新能力得到了进一步的提升，但仍存在着许多亟待解决的问题，主要表现为创新资源短缺、创新意识薄弱、创新形成机制激励不足、产学研协同创新效率不高以及缺乏良好的创新生态环境等问题。因而为加快示范区自主创新能力的提升，各级政府应当加强创新生态环境建设，培育良好的创新文化氛围，重视创新人才的引进和培养，加快推进区域间的合作开放，破除区域间行政壁垒，促进示范区协同发展。